| Arsenal til 2. runde med sammenlagt 9-4 | |
|
| 25.09.1963 | Stævnet - Arsenal 1-7 | | 22.10.1963 | Arsenal - Stævnet 2-3 | |
| 9. | 0-1 | John McLeod | | 1. | 1-0 | Alan Skirton | |
| 24. | 0-2 | Joe Baker | | 30. | 1-1 | Arne Dyrmose | |
| 27. | 0-3 | Geoffrey Strong | | 53. | 2-1 | John Barnwell | |
| 35. | 0-4 | Geoffrey Strong | | 78. | 2-2 | Ole Jørgensen | |
| 40. | 0-5 | Geoffrey Strong | | 88. | 2-3 | Arne Dyrmose | |
| 46. | 0-6 | Joe Baker | |
| 71. | 0-7 | Joe Baker | |
| 81. | 1-7 | Ole Jørgensen (81) | |
|
| FC Liége til 2. runde med sammenlagt 2-0 | |
|
| 04.09.1963 | Aris Bonnevoie - FC Liége 0-2 | | 02.10.1963 | FC Liége - Aris Bonnevoie 0-0 | |
| 50. | 0-1 | Victor Wegria | |
| 68. | 0-2 | Gerard Sulon | |
|
| Atletico Madrid til 2. runde med sammenlagt 2-1 | |
|
| 02.10.1963 | Atletico Madrid - FC Porto 2-1 | | 09.10.1963 | FC Porto - Atletico Madrid 0-0 | |
| 7. | 1-0 | Jose Ribes | |
| 25. | 1-1 | Gibim Romeu | |
| 30. | 2-1 | Jose Ribes | |
|
| Partick Thistle til 2. runde med sammenlagt 7-1 | |
|
| 16.09.1963 | Glentoran - Partick Thistle 1-4 | | 30.09.1963 | Partick Thistle - Glentoran 3-0 | |
| 8. | 0-1 | William Hainey | | 53. | 1-0 | George Smith | |
| 39. | 1-1 | Trevor Thompson | | 67. | 2-0 | George Smith | |
| 58. | 1-2 | Ernest Yard | | 75. | 3-0 | Colin Harvey | |
| 75. | 1-3 | Ernest Yard | |
| 80. | 1-4 | Douglas Wright | |
|
| Roma til 2. runde med sammenlagt 5-1 | |
|
| 16.10.1963 | Hertha Berlin - Roma 1-3 | | 30.10.1963 | Roma - Hertha Berlin 2-0 | |
| 21. | 0-1 | Jürgen Schütz | | 4. | 1-0 | Jürgen Schütz | |
| 32. | 1-1 | Carl-Heinz Rühl | | 70. | 2-0 | Alberto Orlando | |
| 60. | 1-2 | Giancarlo De Sisti | |
| 72. | 1-3 | Lamberto Leonardi | |
|
| Juventus til 2. runde med sammenlagt 4-3 | |
|
| 02.10.1963 | Juventus - OFK Beograd 2-1 | | 16.10.1963 | OFK Beograd - Juventus 2-1 | |
| 34. | 1-0 | Claudio Nene | | 62. | 0-1 | Gino Stacchini | |
| 39. | 1-1 | Dradan Gugleta | | 76. | 1-1 | Dradan Gugleta | |
| 53. | 2-1 | Gianfranco Zigoni | | 83. | 2-1 | Stojan Milosev | |
|
| 30.10.1963 | Juventus - OFK Beograd 1-0 | |
| 82. | 1-0 | Giampaolo Menichelli (82) | |
|
| FC Köln til 2. runde med sammenlagt 4-2 | |
|
| 04.09.1963 | FC Köln - Gent 3-1 | | 16.10.1963 | Gent - FC Köln 1-1 | |
| 20. | 1-0 | Hans Sturm, straffe | | 55. | 0-1 | Wolfgang Overath | |
| 53. | 1-1 | Eric Delmulle | | 57. | 1-1 | Andre de Vos | |
| 54. | 2-1 | Wolfgang Weber | |
| 72. | 3-1 | Hans Sturm, straffe | |
|
| Lausanne Sports til 2. runde med sammenlagt 7-6 | |
|
| 25.09.1963 | Lausanne Sports - Hearts 2-2 | | 09.10.1963 | Hearts - Lausanne Sports 2-2 | |
| 25. | 0-1 | Thomas Traynor | | 19. | 1-0 | John Cumming | |
| 47. | 0-2 | Daniel Ferguson | | 62. | 1-1 | Vittore Gottardi | |
| 56. | 1-2 | Charles Hertig | | 88. | 1-2 | Roberto Hosp | |
| 74. | 2-2 | Vittore Gottardi | | 90. | 2-2 | John Hamilton | |
|
| 15.10.1963 | Lausanne Sports - Hearts 3-2 (2-1;2-2) Efter forlænget spilletid | |
| 13. | 1-0 | Roberto Frigerio | |
| 20. | 2-0 | Richard Dürr, straffe | |
| 30. | 2-1 | William Wallace | |
| 70. | 2-2 | Daniel Ferguson | |
| 103. | 3-2 | Heinz Schneiter | |
|
| Rapid Wien til 2. runde med sammenlagt 4-2 | |
|
| 11.09.1963 | Rapid Wien - RC Paris 1-0 | | 02.10.1963 | RC Paris - Rapid Wien 2-3 | |
| 87. | 1-0 | Rudolf Flögel | | 13. | 1-0 | Guy van Sam | |
| | | | | 17. | 1-1 | Maximilian Schmid | |
| | | | | 20. | 1-2 | Franz Hasil | |
| | | | | 55. | 1-3 | Rudolf Flögel | |
| | | | | 85. | 2-3 | Abderhamman Mahjoub | |
|
| Valencia til 2. runde med sammenlagt 3-2 | |
|
| 18.09.1963 | Shamrock Rovers - Valencia 0-1 | | 10.10.1963 | Valencia - Shamrock Rovers 2-2 | |
| 71. | 0-1 | Suco | | 38. | 0-1 | John Mooney | |
| | | | | 56. | 0-2 | John Mooney | |
| | | | | 62. | 1-2 | Vicente Guillot | |
| | | | | 77. | 2-2 | Alberto Arnal | |
|
| Spartak Brno til 2. runde med sammenlagt 7-1 | |
|
| 02.10.1963 | Spartak Brno - Servette 5-0 | | 16.10.1963 | Servette - Spartak Brno 1-2 | |
| 5. | 1-0 | Jan Brada | | 14. | 1-0 | Michel Desbiolles | |
| 18. | 2-0 | Pando Jankulovsky | | 39. | 1-1 | Karel Komarek | |
| 43. | 3-0 | Karel Komarek | | 70. | 2-1 | Bohuslav Hlavac | |
| 50. | 4-0 | Bohumil Pisek | |
| 54. | 5-0 | Bohuslav Hlavac | |
|
| Lokomotiv Plovdiv til 2. runde med sammenlagt 5-2 | |
|
| 19.09.1963 | Steagul Rosu Brasov - Lokomotiv Plovdiv 1-3 | | 09.10.1963 | Lokomotiv Plovdiv - Steagul Rosu Brasov 2-1 | |
| 4. | 1-0 | Alexandru Meszaros | | 38. | 1-0 | Georgi Mizin | |
| 14. | 1-1 | Petar Kolev | | 39. | 2-0 | Petar Kolev | |
| 30. | 1-2 | Ivan Kanchev | | 89. | 2-1 | Vasile Seredai | |
| 37. | 1-3 | Petar Kolev | |
|
| Belenenses til 2. runde med sammenlagt 4-1 | |
|
| 25.09.1963 | Tresnjevka - Belenenses 0-2 | | 08.10.1963 | Belenenses - Tresnjevka 2-1 | |
| 17. | 0-1 | Fernando Peres | | 4. | 1-0 | Palico | |
| 40. | 0-2 | Estevao | | 28. | 1-1 | Ivica Pintaric | |
| | | | | 70. | 2-1 | Estevao | |
|
| Ujpest Dozsa til 2. runde med sammenlagt 3-2 | |
|
| 04.09.1963 | SC Leipzig - Ujpest Dozsa 0-0 | | 11.09.1964 | Ujpest Dozsa - SC Leipzig 3-2 | |
| | | | | 1. | 1-0 | Pal Varhidi, straffe | |
| | | | | 46. | 2-0 | Ferenc Bene | |
| | | | | 63. | 2-1 | Rainer Trolitzsch | |
| | | | | 68. | 3-1 | Benö Koposzta | |
| | | | | 89. | 3-2 | Henning Frenzel | |
|
| Sheffield Wednesday til 2. runde med sammenlagt 8-2 | |
|
| 25.09.1963 | DOS Utrecht - Sheffield Wednesday 1-4 | | 15.10.1963 | Sheffield Wednesday - DOS Utrecht 4-1 | |
| 5. | 0-1 | Edwin Holiday | | 5. | 1-0 | David Layne | |
| 20. | 0-2 | David Layne | | 14. | 2-0 | Colin Dobson | |
| 49. | 0-3 | John Quinn | | 52. | 3-0 | David Layne | |
| 65. | 1-3 | Sjaak Westphaal | | 70. | 4-0 | David Layne, straffe | |
| 78. | 1-4 | John Quinn | | 87. | 4-1 | Ries van de Bogert | |
|
| Real Zaragoza til 2. runde med sammenlagt 9-1 | |
|
| 08.09.1963 | Iraklis Saloniki - Real Zaragoza 0-3 | | 09.10.1963 | Real Zaragoza - Iraklis Saloniki 6-1 | |
| 43. | 0-1 | Juan Manuel Villa | | 16. | 1-0 | Canario | |
| 61. | 0-2 | Marcelino Martinez | | 35. | 2-0 | Joaquin Murillo | |
| 87. | 0-3 | Juan Manuel Villa | | 46. | 3-0 | Joaquin Murillo | |
| | | | | 56. | 4-0 | Sigi | |
| | | | | 60. | 4-1 | Georgios Lianis | |
| | | | | 82. | 5-1 | Eduardo Enderiz | |
| | | | | 90. | 6-1 | Eduardo Enderiz | |
|
|
|