|
|  Vejle - Otelul Galati | 3 - 0 | 3 - 0 | 6 - 0 | |
| Mura Murska - Silkeborg | 0 - 0 | 0 - 2 | 0 - 2 | |
| FC Zürich - Shakhtar Donetsk | 4 - 0 | 2 - 3 | 6 - 3 | |
| Arges Pitesti - Istanbulspor | 2 - 0 | 2 - 4 | 4 - 4 | Arges videre på udebanemål | |
| Brann - Zalgiris | 1 - 0 | 0 - 0 | 1 - 0 | |
| Germinal - Servette | 1 - 4 | 2 - 1 | 3 - 5 | |
| Ferencvaros - AEK Athen | 4 - 2 | 0 - 4 | 4 - 6 | |
| Glasgow Rangers - PAOK Saloniki | 2 - 0 | 0 - 0 | 2 - 0 | |
| Hajduk Split - Malmö FF | 1 - 1 | 2 - 1 | 3 - 2 | |
| Hapoel Tel Aviv - Strømsgodset | 1 - 0 | 0 - 1 | 1 - 1 | Strømsgodset vandt 4-2 på straffe | |
| IFK Göteborg - Fenerbahce | 2 - 1 | 0 - 1 | 2 - 2 | Fenerbahce videre på udebanemål | |
| Molde - CSKA Sofia | 0 - 0 | 0 - 2 | 0 - 2 | |
| Omonia Nicosia - Rapid Wien | 3 - 1 | 0 - 2 | 3 - 3 | Rapid videre efter udebanemål | |
| Osijek - Anderlecht | 3 - 1 | 0 - 2 | 3 - 3 | Anderlecht videre på udebanemål | |
| Polonia Warszawa - Dynamo Moskva | 0 - 1 | 0 - 1 | 0 - 2 | |
| PS Vaasa - Grazer AK | 0 - 0 | 0 - 3 | 0 - 3 | |
| Røde Stjerne Beograd - Rotor Volgograd | 2 - 1 | 2 - 1 | 4 - 2 | |
| Sigma Olomouc - Kilmarnock | 2 - 0 | 2 - 0 | 4 - 0 | |
| Slavia Prag - Inter Bratislava | 4 - 0 | 0 - 2 | 4 - 2 | |
| Wisla Krakow - Trabzonspor | 5 - 1 | 2 - 1 | 7 - 2 | |
Forside