|   Brøndby til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Brøndby - KR Reykjavik 3-1 | | | | 02.08.2000 | KR Reykjavik - Brøndby 0-0 | |
|   Inter Bratislava til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Haka Valkeakoski - Inter Bratislava 0-0 | | | | 02.08.2000 | Inter Bratislava - Haka Valkeakoski 1-0 | |
|   Røde Stjerne Beograd til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Røde Stjerne Beograd - Torpedo Kutaisi 4-0 | | | | 02.08.2000 | Torpedo Kutaisi - Røde Stjerne Beograd 2-0 | |
|   Helsingborg til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Helsingborg - BATE Borisov 0-0 | | | | 02.08.2000 | BATE Borisov - Helsingborg 0-3 | |
|   Polonia Warszawa til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Dinamo Bukarest - Polonia Warszawa 3-4 | | | | 02.08.2000 | Polonia Warszawa - Dinamo Bukarest 3-1 | |
|   Rosenborg til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Shelbourne - Rosenborg 1-3 | | | | 02.08.2000 | Rosenborg - Shelbourne 1-1 | |
|   Besiktas til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Besiktas - Levski Sofia 1-0 | | | | 02.08.2000 | Levski Sofia - Besiktas 1-1 | |
|   Sturm Graz til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Sturm Graz - Hapoel Tel-Aviv 3-0 | | | | 02.08.2000 | Hapoel Tel-Aviv - Sturm Graz 1-2 | |
|   Zimbru Chisinau til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Zimbru Chisinau - NK Maribor 2-0 | | | | 02.08.2000 | NK Maribor - Zimbru Chisinau 1-0 | |
|   Slavia Prag til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Slavia Prag - Shamkir 1-0 | | | | 02.08.2000 | Shamkir - Slavia Prag 1-4 | |
|   Anderlecht til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Anderlecht - Anorthosis 4-2 | | | | 02.08.2000 | Anorthosis - Anderlecht 0-0 | |
|   Shakhtar Donetsk til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Shakhtar Donetsk - Levadia Maardu 4-1 | | | | 02.08.2000 | Levadia Maardu - Shakhtar Donetsk 1-5 | |
|   Glasgow Rangers til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Glasgow Rangers - FBK Kaunas 4-1 | | | | 02.08.2000 | FBK Kaunas - Glasgow Rangers 0-0 | |
|   Dunaferr til 3. kvalifikationsrunde | |
| | 26.07.2000 | Hajduk Split - Dunaferr 0-2 | | | | 02.08.2000 | Dunaferr - Hajduk Split 2-2 | |
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